Perbedaan utama antara polimorfisme transien dan seimbang didasarkan pada bagaimana alel berperilaku. Polimorfisme transien adalah penggantian progresif satu alel gen dengan alel lain, sedangkan polimorfisme seimbang adalah pemeliharaan kedua alel gen yang berbeda dari waktu ke waktu.
Polimorfisme genetik adalah satu atau dua varian atau lebih dari DNA tertentu. Polimorfisme transien dan seimbang adalah dua jenis polimorfisme yang muncul karena dua alel alternatif suatu gen. Dalam polimorfisme transien, dari dua alel alternatif lokus tertentu, satu alel secara bertahap digantikan oleh yang lain. Dalam polimorfisme seimbang, kedua alel berada dalam kesetimbangan satu sama lain. Kedua versi gen tersebut dipertahankan dalam populasi.
