Perbedaan Kunci - Elektroforesis Gel vs Halaman SDS
Elektroforesis gel adalah teknik yang memisahkan makromolekul dalam suatu medan listrik. Ini adalah metode umum dalam biologi molekuler untuk memisahkan DNA, RNA dan protein dari campuran sesuai dengan ukuran molekulnya. SDS Page adalah salah satu jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein dari campuran protein berdasarkan ukurannya. Elektroforesis gel adalah istilah yang digunakan untuk merujuk pada teknik normal yang diterapkan untuk pemisahan DNA, RNA, dan protein sedangkan SDS Page adalah salah satu jenis elektroforesis gel. Inilah perbedaan utama antara elektroforesis gel dan SDS Page.
DAFTAR ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Elektroforesis Gel
3. Apa itu SDS Halaman
4. Perbandingan Berdampingan - Elektroforesis Gel vs SDS Halaman
5. Ringkasan
Apa itu Elektroforesis Gel?
Elektroforesis gel adalah teknik umum yang digunakan di laboratorium untuk memisahkan molekul bermuatan seperti DNA, RNA, protein, dll. Dari campurannya. Gel digunakan dalam elektroforesis gel. Ini bertindak sebagai saringan molekuler. Ada dua jenis gel yang digunakan dalam elektroforesis gel yaitu agarosa dan poliakrilamida. Pemilihan gel dan sediaan gel merupakan faktor penting yang harus dipertimbangkan dalam elektroforesis gel karena ukuran pori gel harus dimanipulasi dengan hati-hati untuk pemisahan molekul yang baik melalui elektroforesis gel. Elektroforesis gel memiliki medan listrik yang terhubung ke dua ujung gel. Salah satu ujung gel menunjukkan muatan positif sedangkan ujung lainnya bermuatan negatif.
DNA dan RNA adalah molekul bermuatan negatif. Setelah dimasukkan ke dalam gel dari ujung negatif gel dan diaplikasikan ke medan listrik, bahan-bahan tersebut bermigrasi melalui pori-pori gel menuju ujung gel yang bermuatan positif. Kecepatan migrasi bergantung pada muatan dan ukuran molekul. Molekul yang lebih kecil mudah bermigrasi melalui pori-pori gel daripada molekul yang lebih besar. Oleh karena itu, molekul yang lebih kecil menempuh jarak yang jauh melalui gel dan molekul yang lebih besar menempuh jarak yang pendek. Untuk mengamati perjalanan molekul pada gel, jenis pewarna khusus digunakan. Medan listrik diterapkan untuk jangka waktu tertentu dan dihentikan untuk mencegah hilangnya molekul dan untuk menjaga molekul pada posisi perjalanannya. Pita yang berbeda dapat diamati pada gel. Pita-pita ini mewakili molekul dengan ukuran berbeda. Karenanya,Elektroforesis gel berguna untuk membedakan molekul menurut ukurannya.
Elektroforesis gel dimasukkan ke dalam berbagai teknik sebagai teknik preparatif dalam biologi molekuler seperti PCR, RFLP, kloning, sekuensing DNA, south blotting, pemetaan genom, dll.
Gambar 01: Elektroforesis gel agarose
Apa itu Halaman SDS?
Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS Page) adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein. Ketika elektroforesis gel digunakan untuk memisahkan protein, perawatan khusus diperlukan karena protein tidak bermuatan negatif seperti DNA dan RNA dan tidak bermigrasi ke arah ujung positif atau negatif. Oleh karena itu, protein didenaturasi dan dilapisi dengan muatan negatif sebelum elektroforesis gel. Ini dilakukan dengan menggunakan deterjen yang disebut natrium dodesil sulfat (SDS). Elektroforesis gel yang menggunakan SDS dan gel poliakrilamida sebagai media pendukungnya disebut SDS Page. Teknik ini biasa digunakan dalam biokimia, genetika, forensik dan biologi molekuler.
Selama SDS Page, protein dicampur dengan SDS. SDS membongkar protein menjadi bentuk linier dan melapisinya dengan muatan negatif yang sebanding dengan massa molekulnya. Karena muatan negatif, molekul protein bermigrasi menuju ujung muatan positif gel dan terpisah sesuai dengan massa molekulnya. Di SDS Page, poliakrilamida digunakan sebagai penyangga padat untuk gel. Pemisahan protein yang sebenarnya terutama bergantung pada sifat-sifat gel. Oleh karena itu, preparasi gel poliakrilamida harus dilakukan dengan hati-hati dan konsentrasi poliakrilamida yang benar harus digunakan. Gel poliakrilamida menunjukkan resolusi tinggi dibandingkan gel agarosa. Oleh karena itu, SDS Page dianggap sebagai teknik resolusi tinggi untuk pemisahan protein.
SDS Page adalah jenis elektroforesis gel denaturasi. Ini memiliki keterbatasan utama dalam analisis protein. Karena SDS mendenaturasi protein sebelum pemisahan, SDS tidak memungkinkan deteksi aktivitas enzimatis, interaksi pengikatan protein, kofaktor protein, dll.
Gambar 02: Halaman SDS
Apa perbedaan antara Elektroforesis Gel dan SDS Page?
Elektroforesis Gel vs Halaman SDS |
|
Elektroforesis gel adalah metode yang dilakukan untuk memisahkan makromolekul menggunakan medan listrik. | SDS Page adalah teknik elektroforesis gel resolusi tinggi yang digunakan untuk memisahkan protein berdasarkan massanya. |
Gel Run | |
Ini dapat dilakukan secara horizontal atau vertikal. | Halaman SDS selalu berjalan secara vertikal. |
Dasar Pemisahan | |
Pemisahan terjadi sesuai dengan muatan dan ukurannya. | Pemisahan protein terjadi sesuai dengan massa dan muatannya. |
Resolusi | |
Elektroforesis gel agarosa memiliki resolusi rendah dan elektroforesis gel poliakrilamida memiliki resolusi yang lebih tinggi | SDS Page memiliki resolusi yang lebih baik. |
Denaturasi | |
Elektroforesis gel mencakup teknik denaturasi dan non denaturasi. | Halaman SDS mengubah sifat protein sebelum pemisahan. |
Ringkasan - Elektroforesis Gel vs Halaman SDS
Elektroforesis gel adalah teknik umum yang digunakan untuk pemisahan dan analisis DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Ada dua jenis elektroforesis gel utama yaitu elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida. Gel agarosa digunakan terutama untuk pemisahan asam nukleat; bila resolusi yang lebih tinggi diperlukan, gel poliakrilamida digunakan. SDS Page adalah jenis elektroforesis gel yang biasa digunakan untuk memisahkan campuran kompleks protein. Ini dianggap sebagai teknik pemisahan protein resolusi tinggi. Inilah perbedaan antara elektroforesis gel dan SDS Page.