Perbedaan Kunci - Genotipe vs Pengurutan
Genotyping dan sequencing adalah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan informasi tentang asam nukleat, terutama DNA suatu organisme. Perbedaan utama antara genotipe dan sekuensing adalah bahwa genotipe adalah proses menentukan varian genetik mana yang dimiliki individu menggunakan penanda sementara sekuensing adalah penentuan urutan yang benar dari urutan nukleotida dalam fragmen DNA yang diberikan.
DAFTAR ISI
1. Gambaran Umum dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Genotipe
3. Apa itu Pengurutan
4. Perbandingan Berdampingan - Genotipe vs Pengurutan
5. Ringkasan
Apa itu Genotipe?
Genotyping adalah penentuan susunan genetik seseorang menggunakan urutan DNA dan penanda serta perbandingan dan identifikasi pewarisannya. Genotipe penting dalam biologi evolusioner, biologi populasi, taksonomi, ekologi, dan genetika organisme. Hal ini dapat dilakukan dengan teknik yang berbeda termasuk sekuensing DNA, reaksi berantai polimerase, restriksi panjang fragmen polimorfisme (RFLP), deteksi polimorfik diperkuat acak, polimorfisme panjang fragmen yang diperkuat (AFLP), mikroarray DNA, dll.
Genotipe melibatkan sekuensing fragmen kecil tertentu dari sekuens DNA dan menemukan keterkaitan komposisi genetik dengan individu lain menggunakan penanda genetik. Ini menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) di antara individu atau alel tertentu. Genotipe berlaku untuk berbagai organisme termasuk manusia. Ini juga berlaku untuk mikroorganisme seperti virus, jamur dll. Dan dapat digunakan untuk menentukan varian genetiknya dengan profil referensi. Dalam epidemiologi molekuler dan mikrobiologi forensik, pengendalian patogen terutama mikroorganisme dilakukan dengan informasi yang diperoleh dari proses genotyping. Genotipe sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia diberi genotipe untuk mengkonfirmasi keibuan dan kebapakan. Genotipe akan mengungkapkan alel gen dominan dan resesif yang menentukan sifat-sifat tertentu.
Gambar_1: Genotipe RFLP
Apa itu Pengurutan?
Pengurutan adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar dalam suatu fragmen DNA atau RNA. Hampir semua informasi yang diperlukan untuk pertumbuhan dan perkembangan organisme dikodekan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk menghasilkan dan memisahkan beberapa ratus fragmen asam nukleat panjang nukleotida mengarah pada pengembangan prosedur untuk menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA tertentu. Berbagai jenis metode pengurutan tersedia saat ini. Metode pengurutan ini, bersama dengan teknologi untuk pembangunan perpustakaan genom yang mewakili seluruh genom organisme, memfasilitasi pengurutan seluruh genom organisme tersebut, membuat analisis mendalam tentang struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, wilayah pengaturan gen, dll.
Genom total dari banyak virus, beberapa bakteri, archaebacteria, ragi dan beberapa organisme lain telah diurutkan dan dipetakan. Proyek genom manusia telah memungkinkan untuk mengurutkan dan memetakan seluruh genom manusia dan menerbitkan draf pertamanya pada tahun 2003. Ini merupakan tonggak penting dalam kemajuan biologi. Urutan genom manusia sekarang digunakan di sektor medis untuk mengidentifikasi penyebab genetik untuk penyakit langka, menyaring risiko penyakit pada bayi baru lahir, mengidentifikasi detail genetik dari berbagai kanker, mengembangkan terapi baru, dan mengembangkan alat diagnostik baru, dll.
Di dunia tumbuhan, genom padi dan genom Arabidopsis telah diurutkan. Pengetahuan tentang urutan ini tidak diragukan lagi akan merevolusi pemahaman kita tentang bagaimana sel dan organisme berfungsi.
Gambar_2: Autoradiograf sekuensing sanger
Apa perbedaan antara Genotyping dan Sequencing?
Artikel Diff Tengah sebelum Tabel
Genotipe vs Pengurutan |
|
| Genotipe adalah proses menentukan komposisi genetik seseorang dan memeriksa kelompok atau taksonomi organisme itu. | Pengurutan adalah proses menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA tertentu. |
| Teknik | |
| RFLP, Pengurutan gen, PCR, mikroarray DNA, AFLP dll. | Pengurutan Sanger, Pengurutan Gilbert, Pengurutan Pyrosequencing, Pengurutan Generasi Berikutnya, Pengurutan Shotgun, dll. |
| Kekhawatiran Utama | |
| Ini lebih memperhatikan apakah perbedaan genotipe memberikan perbedaan fenotipe yang sebenarnya. | Ini lebih memperhatikan tentang urutan nukleotida dan perbedaan serta perubahannya dengan organisme lain. |
Ringkasan - Genotipe vs Pengurutan
Genotyping dan sequencing berguna untuk mempelajari informasi genetik organisme. Genotipe adalah proses menentukan variasi genotipe antar individu dan menemukan kategorinya. Pengurutan adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen atau wilayah DNA yang tertarik. Kedua teknik tersebut memberikan informasi penting tentang gen dan genom.
